Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA9Q13797 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
ITGA9Q13797 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
ITGA9Q13797 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ITGA9Q13797 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ITGA9Q13797 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ITGA9Q13797 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ITGA9Q13797 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ITGA9Q13797 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ITGA9Q13797 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms