Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AC004870.2-201ENST00000445615 831 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
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ITGB3BPQ13352 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
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ITGB3BPQ13352 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
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ITGB3BPQ13352 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
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