Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 PIRT-201ENST00000580256 3810 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 CT45A7-201ENST00000610598 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 FAM71F1-207ENST00000485070 1574 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 FAM71F1-209ENST00000621392 1591 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 TDRD1-201ENST00000251864 4510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 BX322650.1-201ENST00000332359 2143 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 GSTM2-207ENST00000460717 1449 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 ORC3-206ENST00000546266 2470 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 TCL6-203ENST00000459662 3307 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 SAR1A-206ENST00000431664 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC092111.1-201ENST00000618256 3358 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 MTCO1P25-201ENST00000414449 1799 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 CCNJP2-201ENST00000457810 1163 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 INTS12-202ENST00000394735 1927 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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