Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC7.27□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CHAF1AQ13111 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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