Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TTPAP49638 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TTPAP49638 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
TTPAP49638 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
TTPAP49638 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
TTPAP49638 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
TTPAP49638 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
TTPAP49638 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
TTPAP49638 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TTPAP49638 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TTPAP49638 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TTPAP49638 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TTPAP49638 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TTPAP49638 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TTPAP49638 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TTPAP49638 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TTPAP49638 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TTPAP49638 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TTPAP49638 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TTPAP49638 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TTPAP49638 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TTPAP49638 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TTPAP49638 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TTPAP49638 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TTPAP49638 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TTPAP49638 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TTPAP49638 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TTPAP49638 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TTPAP49638 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TTPAP49638 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TTPAP49638 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TTPAP49638 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TTPAP49638 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TTPAP49638 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TTPAP49638 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TTPAP49638 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TTPAP49638 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TTPAP49638 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TTPAP49638 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms