Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 TINAG-201ENST00000259782 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AP001610.2-201ENST00000415820 422 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AC016573.1-201ENST00000523205 539 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms