Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 CXADRP3-202ENST00000617265 1100 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms