Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AL139350.1-201ENST00000448825 408 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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