Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AC040934.1-201ENST00000523101 513 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 MIR744-201ENST00000578242 98 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 LINC01291-202ENST00000418204 441 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 LDHAP1-201ENST00000509421 992 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 BCAS2P1-201ENST00000528022 632 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms