Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NRF1Q16656 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms