Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 ITPR1-202ENST00000354582 10242 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 SALL4P7-201ENST00000555779 3120 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 ATP2B4-204ENST00000367218 8918 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 FTH1P10-202ENST00000430907 550 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
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VPS72Q15906 DNM1L-203ENST00000381000 4397 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 FAM47E-202ENST00000502320 6249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 TTC39B-208ENST00000512701 10483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
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VPS72Q15906 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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VPS72Q15906 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 ZBTB34-202ENST00000373452 6528 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 ABLIM1-214ENST00000533213 7606 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 UTP15-201ENST00000296792 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
VPS72Q15906 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
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