Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC015726.1-202ENST00000602532 475 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 TINAG-201ENST00000259782 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 TMED2-203ENST00000509052 1975 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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