Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 RBBP4P5-201ENST00000398583 1266 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 RBMY2AP-201ENST00000445405 1157 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 RBMY2CP-201ENST00000448575 1157 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 RBMY2DP-202ENST00000448881 1157 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 GLRX-203ENST00000505427 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 AC078864.1-201ENST00000547538 512 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 AL137847.1-201ENST00000416473 444 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 RBM7-208ENST00000545678 867 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 AC145285.4-201ENST00000568183 540 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 AC022021.1-201ENST00000634334 843 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms