Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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TRAF1Q13077 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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TRAF1Q13077 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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TRAF1Q13077 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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TRAF1Q13077 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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TRAF1Q13077 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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TRAF1Q13077 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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TRAF1Q13077 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TRAF1Q13077 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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