Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T2

Thbs4, Thrombospondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs4Q9Z1T2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs4Q9Z1T2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms