Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F4

Cib1, Calcium and integrin-binding protein 1, mousemouse

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Length 191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib1Q9Z0F4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cib1Q9Z0F4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cib1Q9Z0F4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms