Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srd5a3Q9WUP4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srd5a3Q9WUP4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms