Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psma1Q9R1P4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psma1Q9R1P4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms