Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms