Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERS2

Ndufa13, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa13Q9ERS2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ndufa13Q9ERS2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ndufa13Q9ERS2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ndufa13Q9ERS2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ndufa13Q9ERS2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ndufa13Q9ERS2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Ndufa13Q9ERS2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Ndufa13Q9ERS2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufa13Q9ERS2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Ndufa13Q9ERS2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndufa13Q9ERS2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndufa13Q9ERS2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Ndufa13Q9ERS2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufa13Q9ERS2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufa13Q9ERS2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufa13Q9ERS2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufa13Q9ERS2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufa13Q9ERS2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufa13Q9ERS2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ndufa13Q9ERS2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms