Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tvp23bQ9D8T4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms