Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb4aQ9D6F9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb4aQ9D6F9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms