Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc83Q9D4V3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms