Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Efhd1Q9D4J1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efhd1Q9D4J1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efhd1Q9D4J1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efhd1Q9D4J1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efhd1Q9D4J1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efhd1Q9D4J1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efhd1Q9D4J1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efhd1Q9D4J1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efhd1Q9D4J1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Efhd1Q9D4J1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efhd1Q9D4J1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efhd1Q9D4J1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efhd1Q9D4J1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efhd1Q9D4J1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efhd1Q9D4J1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efhd1Q9D4J1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efhd1Q9D4J1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efhd1Q9D4J1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efhd1Q9D4J1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efhd1Q9D4J1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efhd1Q9D4J1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efhd1Q9D4J1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efhd1Q9D4J1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efhd1Q9D4J1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efhd1Q9D4J1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Efhd1Q9D4J1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efhd1Q9D4J1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efhd1Q9D4J1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efhd1Q9D4J1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efhd1Q9D4J1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efhd1Q9D4J1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efhd1Q9D4J1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efhd1Q9D4J1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efhd1Q9D4J1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efhd1Q9D4J1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Efhd1Q9D4J1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efhd1Q9D4J1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efhd1Q9D4J1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Efhd1Q9D4J1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efhd1Q9D4J1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efhd1Q9D4J1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efhd1Q9D4J1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efhd1Q9D4J1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efhd1Q9D4J1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efhd1Q9D4J1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efhd1Q9D4J1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efhd1Q9D4J1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efhd1Q9D4J1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms