Protein–RNA interactions for Protein: Q9D132

Upk1a, Uroplakin-1a, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1aQ9D132 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upk1aQ9D132 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms