Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TINF2Q9BSI4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms