Protein–RNA interactions for Protein: Q99KI3

Emc3, ER membrane protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emc3Q99KI3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Emc3Q99KI3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Emc3Q99KI3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Emc3Q99KI3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Emc3Q99KI3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emc3Q99KI3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emc3Q99KI3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emc3Q99KI3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emc3Q99KI3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emc3Q99KI3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emc3Q99KI3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emc3Q99KI3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Emc3Q99KI3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms