Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Atl3Q91YH5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atl3Q91YH5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms