Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms