Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC6

Ccm2l, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2lQ8VCC6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccm2lQ8VCC6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccm2lQ8VCC6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccm2lQ8VCC6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccm2lQ8VCC6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccm2lQ8VCC6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccm2lQ8VCC6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccm2lQ8VCC6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccm2lQ8VCC6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccm2lQ8VCC6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccm2lQ8VCC6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccm2lQ8VCC6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccm2lQ8VCC6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccm2lQ8VCC6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccm2lQ8VCC6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccm2lQ8VCC6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccm2lQ8VCC6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccm2lQ8VCC6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccm2lQ8VCC6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccm2lQ8VCC6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccm2lQ8VCC6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccm2lQ8VCC6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccm2lQ8VCC6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccm2lQ8VCC6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccm2lQ8VCC6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccm2lQ8VCC6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccm2lQ8VCC6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccm2lQ8VCC6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccm2lQ8VCC6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccm2lQ8VCC6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccm2lQ8VCC6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccm2lQ8VCC6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccm2lQ8VCC6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccm2lQ8VCC6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccm2lQ8VCC6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccm2lQ8VCC6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccm2lQ8VCC6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccm2lQ8VCC6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccm2lQ8VCC6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms