Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHDC4Q8TBB5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC4Q8TBB5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms