Protein–RNA interactions for Protein: Q76N33

Stambpl1, AMSH-like protease, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stambpl1Q76N33 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Stambpl1Q76N33 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stambpl1Q76N33 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stambpl1Q76N33 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stambpl1Q76N33 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stambpl1Q76N33 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stambpl1Q76N33 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stambpl1Q76N33 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stambpl1Q76N33 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stambpl1Q76N33 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stambpl1Q76N33 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms