Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE6

LCN10, Epididymal-specific lipocalin-10, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN10Q6JVE6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LCN10Q6JVE6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LCN10Q6JVE6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LCN10Q6JVE6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LCN10Q6JVE6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LCN10Q6JVE6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LCN10Q6JVE6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LCN10Q6JVE6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms