Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ1

RPGRIP1L, Protein fantom, humanhuman

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1LQ68CZ1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPGRIP1LQ68CZ1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPGRIP1LQ68CZ1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPGRIP1LQ68CZ1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPGRIP1LQ68CZ1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RPGRIP1LQ68CZ1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPGRIP1LQ68CZ1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPGRIP1LQ68CZ1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPGRIP1LQ68CZ1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPGRIP1LQ68CZ1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPGRIP1LQ68CZ1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPGRIP1LQ68CZ1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPGRIP1LQ68CZ1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPGRIP1LQ68CZ1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPGRIP1LQ68CZ1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RPGRIP1LQ68CZ1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPGRIP1LQ68CZ1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPGRIP1LQ68CZ1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPGRIP1LQ68CZ1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RPGRIP1LQ68CZ1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPGRIP1LQ68CZ1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RPGRIP1LQ68CZ1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPGRIP1LQ68CZ1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPGRIP1LQ68CZ1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPGRIP1LQ68CZ1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPGRIP1LQ68CZ1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RPGRIP1LQ68CZ1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPGRIP1LQ68CZ1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPGRIP1LQ68CZ1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPGRIP1LQ68CZ1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPGRIP1LQ68CZ1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPGRIP1LQ68CZ1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RPGRIP1LQ68CZ1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RPGRIP1LQ68CZ1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RPGRIP1LQ68CZ1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RPGRIP1LQ68CZ1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RPGRIP1LQ68CZ1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RPGRIP1LQ68CZ1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RPGRIP1LQ68CZ1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RPGRIP1LQ68CZ1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RPGRIP1LQ68CZ1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RPGRIP1LQ68CZ1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPGRIP1LQ68CZ1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms