Protein–RNA interactions for Protein: Q60855

Ripk1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk1Q60855 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms