Protein–RNA interactions for Protein: Q01063

Pde4d, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4dQ01063 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde4dQ01063 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde4dQ01063 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde4dQ01063 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde4dQ01063 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde4dQ01063 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde4dQ01063 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde4dQ01063 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde4dQ01063 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde4dQ01063 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde4dQ01063 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde4dQ01063 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde4dQ01063 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde4dQ01063 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde4dQ01063 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde4dQ01063 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde4dQ01063 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde4dQ01063 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde4dQ01063 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde4dQ01063 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde4dQ01063 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde4dQ01063 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde4dQ01063 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde4dQ01063 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde4dQ01063 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde4dQ01063 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde4dQ01063 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde4dQ01063 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde4dQ01063 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde4dQ01063 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde4dQ01063 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde4dQ01063 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde4dQ01063 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde4dQ01063 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pde4dQ01063 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pde4dQ01063 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Pde4dQ01063 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pde4dQ01063 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pde4dQ01063 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pde4dQ01063 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pde4dQ01063 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pde4dQ01063 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pde4dQ01063 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pde4dQ01063 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pde4dQ01063 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pde4dQ01063 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pde4dQ01063 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pde4dQ01063 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pde4dQ01063 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms