Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms