Protein–RNA interactions for Protein: P61028

Rab8b, Ras-related protein Rab-8B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8bP61028 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab8bP61028 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab8bP61028 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab8bP61028 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab8bP61028 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab8bP61028 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab8bP61028 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab8bP61028 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab8bP61028 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab8bP61028 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab8bP61028 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab8bP61028 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab8bP61028 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab8bP61028 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab8bP61028 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab8bP61028 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab8bP61028 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab8bP61028 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab8bP61028 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab8bP61028 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab8bP61028 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab8bP61028 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab8bP61028 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab8bP61028 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab8bP61028 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab8bP61028 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab8bP61028 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab8bP61028 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Rab8bP61028 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab8bP61028 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab8bP61028 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab8bP61028 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab8bP61028 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab8bP61028 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab8bP61028 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab8bP61028 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab8bP61028 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab8bP61028 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab8bP61028 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab8bP61028 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab8bP61028 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab8bP61028 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab8bP61028 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Rab8bP61028 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Rab8bP61028 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab8bP61028 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab8bP61028 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab8bP61028 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab8bP61028 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab8bP61028 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Rab8bP61028 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab8bP61028 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Rab8bP61028 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab8bP61028 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab8bP61028 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Rab8bP61028 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Rab8bP61028 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Rab8bP61028 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Rab8bP61028 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Rab8bP61028 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rab8bP61028 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab8bP61028 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab8bP61028 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab8bP61028 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab8bP61028 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Rab8bP61028 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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