Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VimP20152 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VimP20152 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VimP20152 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VimP20152 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VimP20152 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VimP20152 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VimP20152 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VimP20152 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VimP20152 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VimP20152 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VimP20152 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VimP20152 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VimP20152 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VimP20152 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VimP20152 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VimP20152 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VimP20152 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VimP20152 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VimP20152 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VimP20152 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VimP20152 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VimP20152 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VimP20152 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VimP20152 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VimP20152 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VimP20152 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VimP20152 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VimP20152 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
VimP20152 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VimP20152 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VimP20152 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VimP20152 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VimP20152 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
VimP20152 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VimP20152 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
VimP20152 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VimP20152 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VimP20152 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VimP20152 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VimP20152 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VimP20152 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VimP20152 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VimP20152 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VimP20152 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VimP20152 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VimP20152 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VimP20152 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VimP20152 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
VimP20152 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VimP20152 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VimP20152 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VimP20152 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VimP20152 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VimP20152 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VimP20152 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VimP20152 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VimP20152 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VimP20152 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VimP20152 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VimP20152 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VimP20152 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VimP20152 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VimP20152 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VimP20152 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VimP20152 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VimP20152 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
VimP20152 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VimP20152 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VimP20152 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VimP20152 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
VimP20152 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VimP20152 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VimP20152 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VimP20152 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VimP20152 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VimP20152 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VimP20152 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VimP20152 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VimP20152 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VimP20152 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VimP20152 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VimP20152 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VimP20152 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VimP20152 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VimP20152 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VimP20152 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VimP20152 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VimP20152 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VimP20152 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VimP20152 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VimP20152 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VimP20152 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VimP20152 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VimP20152 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VimP20152 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VimP20152 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VimP20152 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VimP20152 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VimP20152 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms