Protein–RNA interactions for Protein: P09174

Pde6g, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6gP09174 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Pde6gP09174 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Pde6gP09174 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Pde6gP09174 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pde6gP09174 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pde6gP09174 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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