Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtrP07309 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtrP07309 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtrP07309 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtrP07309 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtrP07309 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtrP07309 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtrP07309 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TtrP07309 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtrP07309 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtrP07309 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtrP07309 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtrP07309 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtrP07309 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtrP07309 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtrP07309 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtrP07309 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtrP07309 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtrP07309 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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TtrP07309 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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TtrP07309 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtrP07309 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtrP07309 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtrP07309 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtrP07309 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtrP07309 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtrP07309 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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TtrP07309 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtrP07309 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtrP07309 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtrP07309 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtrP07309 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtrP07309 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtrP07309 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtrP07309 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtrP07309 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtrP07309 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtrP07309 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtrP07309 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtrP07309 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtrP07309 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtrP07309 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TtrP07309 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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TtrP07309 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TtrP07309 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
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TtrP07309 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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TtrP07309 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TtrP07309 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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TtrP07309 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtrP07309 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtrP07309 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtrP07309 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtrP07309 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtrP07309 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TtrP07309 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtrP07309 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtrP07309 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtrP07309 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtrP07309 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtrP07309 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtrP07309 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtrP07309 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtrP07309 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtrP07309 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtrP07309 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtrP07309 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtrP07309 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtrP07309 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtrP07309 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtrP07309 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtrP07309 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtrP07309 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtrP07309 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TtrP07309 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TtrP07309 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TtrP07309 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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