Protein–RNA interactions for Protein: O08738

Casp6, Caspase-6, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp6O08738 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Casp6O08738 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Casp6O08738 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casp6O08738 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casp6O08738 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casp6O08738 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casp6O08738 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casp6O08738 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casp6O08738 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms