Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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