Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC079075.2-201ENST00000557964 449 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC018767.2-201ENST00000562361 600 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TAF1AQ15573 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.3 ms