Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 CLC-201ENST00000221804 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AL359885.1-201ENST00000415786 903 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 RBBP4P5-201ENST00000398583 1266 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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