Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC9.16□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC9.15□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AL139231.1-201ENST00000431001 312 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 HMGN1P17-201ENST00000513734 295 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC9.15□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC016405.1-202ENST00000524348 758 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 DAAM1-208ENST00000556135 582 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms