Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
E2F1Q01094 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.3 ms