Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ACTBP60709 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ACTBP60709 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ACTBP60709 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ACTBP60709 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ACTBP60709 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ACTBP60709 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ACTBP60709 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ACTBP60709 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ACTBP60709 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ACTBP60709 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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ACTBP60709 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ACTBP60709 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ACTBP60709 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AC010086.1-201ENST00000437359 1052 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ACTBP60709 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ACTBP60709 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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ACTBP60709 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ACTBP60709 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ACTBP60709 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ACTBP60709 OR7E158P-201ENST00000524483 910 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ACTBP60709 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ACTBP60709 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AL359232.1-202ENST00000556874 1206 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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ACTBP60709 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ACTBP60709 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ACTBP60709 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ACTBP60709 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ACTBP60709 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AC048341.3-201ENST00000619323 491 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ACTBP60709 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ACTBP60709 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ACTBP60709 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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ACTBP60709 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ACTBP60709 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ACTBP60709 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ACTBP60709 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ACTBP60709 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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ACTBP60709 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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ACTBP60709 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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ACTBP60709 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ACTBP60709 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ACTBP60709 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ACTBP60709 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
ACTBP60709 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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ACTBP60709 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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ACTBP60709 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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ACTBP60709 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ACTBP60709 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ACTBP60709 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ACTBP60709 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ACTBP60709 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ACTBP60709 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ACTBP60709 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ACTBP60709 TTC39C-AS1-201ENST00000579713 817 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ACTBP60709 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ACTBP60709 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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