Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 STAG2-201ENST00000218089 5218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
MSCO60682 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
MSCO60682 GPN1-203ENST00000424214 1725 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
MSCO60682 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
MSCO60682 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
MSCO60682 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 TOM1L1-220ENST00000575333 1849 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 PBLD-204ENST00000358769 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 MRAP-202ENST00000339944 440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 LINC02270-202ENST00000515691 541 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
MSCO60682 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
MSCO60682 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
MSCO60682 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
MSCO60682 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
MSCO60682 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
MSCO60682 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
MSCO60682 MTIF2-201ENST00000263629 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
MSCO60682 FO082842.1-201ENST00000423552 1370 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
MSCO60682 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
MSCO60682 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
MSCO60682 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
MSCO60682 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
MSCO60682 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
MSCO60682 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
MSCO60682 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
MSCO60682 ITPR1-202ENST00000354582 10242 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
MSCO60682 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
MSCO60682 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
MSCO60682 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
MSCO60682 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
MSCO60682 BRD7-202ENST00000394689 2145 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
MSCO60682 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
MSCO60682 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
MSCO60682 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
MSCO60682 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
MSCO60682 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
MSCO60682 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
MSCO60682 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
MSCO60682 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
MSCO60682 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
MSCO60682 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
MSCO60682 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
MSCO60682 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms