Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AL078623.1-201ENST00000602702 907 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC063943.2-201ENST00000495697 534 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC027309.1-201ENST00000519976 528 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC008662.1-201ENST00000521805 674 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
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